J'ai remarqué ce problème aussi sur mon ibook, et après avoir regardé dans la liste des modules chargés, j'ai remarqué que le module "therm_adt746x" n'était pas chargé automatiquement. Or, ce module gère les ventilos sous Linux...
Donc essaie de voir si ca marche mieux après un :
sudo modprobe therm_adt746x
Et si ca marche mieux, ajoute therm_adt746x au fichier /etc/modules et il sera chargé automatiquement au démarrage.
Plus d'informations sur comment controler ce module :
http://forum.macbidouille.com/index.php?showtopic=183655