jbLinux,
Si tu arrives à créer une liveUSB avec LiLi comme proposé par gaara92, je te propose de
ne pas connecter ton disque dur externe et de répondre à cette demande (Créer un rapport Boot-Info) :
http://doc.ubuntu-fr.org/tutoriel/boot-info
Comme Boot-Info montre bien la configuration et les traces de Ubuntu, je pourrai te dire comment supprimer toute trace de Ubuntu dans ton disque interne.
Pour les soucis que tu rencontres avec ton disque externe, on verra après.