J'ai eu exactement le même problème sous Lubuntu 14.04 et Skype 4.3. (écoute normale mais pas de son du micro)
Sur d'autre ordinateurs il n'y avait aucun problème...
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Pour vérifier si c'était l'ordinateur ou l'installation, j'ai allumé l'ordinateur avec une clé USB bootable de Lubuntu Live 14.04. Une fois connecté, j'ai ajouté les les dépôts partenaires par Synaptic avec la ligne suivante :
deb
http://archive.canonical.com/ubuntu trusty partner
puis j'ai installé pavucontrol et skype. Et Skype fonctionne, y compris le micro.
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Le problème de la version installée sur le disque dur, était donc les fichiers de configuration. Voici comment je suis arrivé aux résultats :
1 Dans Synaptic, j'ai supprimé complètement skype pavucontrol et pulseaudio
2 J'ai supprimé les 3 dossiers suivant du répertoire personnel : .Skype .config/pulse .config/Skype
3 Puis, j'ai réinstallé par synaptic skype pavucontrol et pulseaudio
Et en ouvrant skype le micro fonctionne (j'ai du régler le son dans pavucontrol) !
Remarque : Pavucontrol est situé dans le groupe "Son et Vidéo" sous le nom "Contrôle du Volume PulseAudio"