SBackup ou autre backup regroupe et compresse les fichiers.
rsync synchronise des répertoires, les fichiers sont intacte donc lisible par les 2 systèmes.
A toi de te faire un petit script pour monter(voir
mount/umount) la partition windows, utiliser rsync avec les bon paramètres pour faire tes sauvegardes Linux et Windows.
Après, ton script peu être appelé par cron pour l'automatiser.
IL est aussi possible de faire un 2em petit script de restauration.
IL y a aussi une implémentation de rsync pour windows mais avec beaucoup moins d'options.
Pour la sauvegarde de disque entier, il faut utiliser d'un live-CD ou live USB pour qu'aucune partition ne soit en cours d'utilisation puis se servir de (DD + gzip en ligne de commande) ou partition magic.