Salut !
Alors, déjà, ne JAMAIS lancer un programme graphique avec sudo. Beaucoup de gens le font, et trouvent que ça marche, mais le jour où le programme écrit en root dans tes fichiers de config, c'est la cata...
Que donne:
ll -Ra | grep root
lancé dans le dossier ~/.thunderbird (et dans le home tant qu'on y est) ?
Possible que ça vienne du fait que "sudo thunderbird" ait écrit des fichiers en root quelque part, auxquels l'utilisateur normal n'a plus accès (du coup).
Pour lancer en "admin", préférer la commande kdesu (si sous KDE).
