Non non ça n'a pas disparu ça marche pareil sous 16.04.
Tu as donc fait une mise à niveau de 14.04 à 16.04, pas une réinstallation complète, neuve ?
Essaie déjà ceci, ça enlèvera traces de l'ancien cache de compiz :
cd .cache
mv compizconfig-1 compizconfig-1_old
redémarrer la session ou l'ordi ensuite.
Si pas d'amélioration, réinitialiser Unity via :
dconf reset -f /org/compiz/ && setsid unity
ça remettra Unity à ses paramètres d'origine ( donc il faudra refaire tes éventuels réglages perso's ).
Si toujours pas mieux il faudra regarder les réglages d'Unity et des fenêtres dans compiz-config-settings-manager…