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Problème Instalation Phreeqc

FlouretA

Bonjour/Bonsoir,

Je commence sur ubuntu 16.04 et jusqu'a maintenant grâce au forum et autre wiki j'ai pu survivre dans ce nouvelle environnement =). Mais là ça coince. Je m'explique, dans le cadre de ma thèse je dois utiliser un logiciel nommé Phreeqc qui sert a modéliser des réactions chimiques et c'est bien cool =) sur mon pc du boulot no problème car installé via window qui fais tous le boulot =). Par contre via mon pc à la maison ça coince vu que je suis sous ubuntu. Sous la version linux de Phreeqc il n'y a pas de fichier qui lance l’exécution du logiciel d’après ce que j'ai lu il faut que je compile moi même pour que le logiciel s’installe via Cmake ou un truc du genre et là je bloque....
Je ne sais pas si j'ai bien était claire.... En gros j'arrive pas a installé Phreeqc car je dois le compiler et je capte pas trop comment je dois faire ça.....

Le lien envoie sur la page de l'USGS qui fournie ce magnifique logiciel. Qui pourra peut être interreser les chimistes en herbe =)

Merci pour votre aide. A+

FlouretA

Un petit up je n'arrive toujours pas à compiler les fichier j'ai essayer avec alien mais celà ne fonctionne pas......

Stranger13

Bonjour,

Je suis dans la même situation que vous. J'ai trouvé ce site qui explique la compilation avec un autre programme, htop, en utilisant terminal (une interface incontournable si on veut installer des programmes peu utilisés sur Linux). Il suffit de reproduire le tutoriel en remplaçant htop par phreeqc (en veillant à bien spécifier les dossier d'emplacement qui seront propre à votre ordinateur). Cependant, ça bloque à la fin de l'installation. Tout à l'air d'aller, sauf que quand je veux lancer le logiciel, je ne sais pas comment m'y prendre, les commandes "phreeqc" ou "iphreeqc" ne donnent rien et il n'y a d'icône phreeqc nulle part. Peut-être qu'il y a eu une erreur dans l'étape "make install" capture écran terminal.

Bonne continuation, en joignant nos efforts on est plus forts !

Rafbor

Salut, si tu as fait les 3 étapes

./configure
$ make
$ sudo make install

et que tout est ok, c'est terminé.
Le problème est peut être sur l'utilisation du soft. D'après ce tuto https://www.simonwenkel.com/2019/02/02/Compiling-PHREEQC-on-Linux.html il faut copier des données avant de pouvoir utiliser le soft.

Stranger13

Bonjour,

Si tout est ok, ou est le fichier permettant de lancer le programme ?

Merci

Rafbor

L'exécutable doit être dans un dossier système comme /usr/bin ou /usr/local/bin, ça dépend du script d'installation.
La commande phreeqc te renvoie une erreur ?

Edit: sans paramètre, elle demande de saisir un nom de fichier de données
Tu dois suivre le tuto que je t'ai posté pour ajouter des données à exploiter.

Stranger13

J'ai ajouter le fichier QC_ThermoddemV1.10_15Dec2020.dat dans le dossier préconisé par le tuto. Il y a un fichier libiphreeqc.la qui est une application, mais rien ne se passe quand je double clique dessus.

gl38

Arrête de cliquer !
À supposer que la compilation se soit bien passée, en ouvrant un terminal et en tapant

whereis phreeqc

tu dois obtenir quelque chose comme

phreeqc: /usr/local/bin/phreeqc

Le programme vient avec plein d'exemples, il suffit de faire ce qui est dit dans le fichier indiqué par Raftor au #4 avec l'exemple ex1.
Cordialement,
Guy

Stranger13

Bonjour,

Si je suis les commandes exactement comme indiqué dans le fichier de Raftor, il ne se passe rien. Il faut bien à un moment ou à un autre que le programme s'ouvre. Avez-vous essayé de votre côté ?

Cordialement,

Grégoire

Rafbor

Je confirme qu'en suivant le tuto, tout fonctionne et j'obtiens les mêmes résultats.

Difficile de t'aider, tu ne réponds pas aux questions qu'on t'a posé en #6 et #8, on ne sait donc pas si tu as bien compilé les sources et installé l'appli.