C'est possible que le paquet fourni par Virtualbox soit packagé différemment de celui qui est dans les dépôts, d'où conflit. Essaie de désinstaller la version actuelle avant de tenter d'installer la nouvelle.
À noter qu'il y a
un dépôt dédié qui permet d'installer plus facilement les paquets et de les mettre à jour le cas échéant.