Rien d'anormal dans les sources (à part que le dépôt de MKVToolnix devrait plutôt être dans un fichier .list à part mais ça ne change rien concrètement).
Je n'arrive pas à comprendre comment ta situation peut être possible : pour résumer, le paquet principal de l'environnement Unity (ubuntu-desktop), qui devrait être installé par défaut et donc avoir accès à toutes ses dépendances, en a deux qui ne se trouvent pas dans les dépôts. C'est assez bizarre.
On va quand même vérifier d'autres choses. Va dans les paramètres système → Logiciels & mises à jour. Là, tu vas vérifier que dans le premier onglet les quatre premières options sont bien cochées (les dépôts main, universe, restricted et multiverse). Tu vas aussi passer sur le serveur principal au lieu du serveur français. Dans le troisième onglet (Mises à jour), vérifie que les trois premières options sont bien cochées (dépôts trusty-security, trusty-updates et trusty-backports). Vérifie aussi que le dépôt trusty-proposed est bien
décoché (en 16.10, il est dans un onglet "Options de développement" mais je ne sais plus s'il était déjà rangé là sur ta version).
Une fois que c'est fait, retente :
sudo apt-get update
sudo apt-get install ubuntu-desktop