Le gros avantage des machines virtuelles c'est la maîtrise du hardware.
Avec virtualbox tu peux contrôler la ram de la carte vidéo, accélération 2D ou pas etc...
De même avec le cpu, tu peux choisir qu'un seul core avec "ressources allouées" à 10% etc...
Inutile de partir dans des complications comme machine virtuelle dans une machine virtuelle etc...
Petit rappel, wine is not an emulator, ça n'apporte aucune maîtrise du hardware, le mieux qu'on puisse faire c'est de fixer des quotas aux processus wine pour les ralentir mais ça reste aléatoire.
Tu peux aussi utiliser kvm + cgroups grâce auquel tu peux avoir un réglage très fin des ressources allouées à une vm, tu peux régler à l'image/s près.
Un exemple :
http://blog.scoutapp.com/articles/2014/11/04/restricting-process-cpu-usage-using-nice-cpulimit-and-cgroups
