Pour Libre-Office, ça peut aussi dépendre de ses réglages « internes » : utilise-t-il le thème système ou un thème choisi par l'utilisateur ? Ça se trouve dans le menu de LO → options → affichage / personnalisation.
Et si des paquets de style pour LO sont installés, tout comme les « intégrateurs » de style correspondants…
coeurnoir@Asgard:~$ dpkg -l | grep libreoffice
(…)
ii libreoffice-gnome 1:5.1.6~rc2-0ubuntu1~xenial2 amd64 office productivity suite -- GNOME integration
ii libreoffice-gtk 1:5.1.6~rc2-0ubuntu1~xenial2 amd64 office productivity suite -- GTK+ integration
(…)
ii libreoffice-style-breeze 1:5.1.6~rc2-0ubuntu1~xenial2 all office productivity suite -- Breeze symbol style
ii libreoffice-style-galaxy 1:5.1.6~rc2-0ubuntu1~xenial2 all office productivity suite -- Galaxy (Default) symbol style
ii libreoffice-style-oxygen 1:5.1.6~rc2-0ubuntu1~xenial2 all office productivity suite -- Oxygen symbol style
ii libreoffice-style-sifr 1:5.1.6~rc2-0ubuntu1~xenial2 all office productivity suite -- Sifr symbol style
ii libreoffice-style-tango 1:5.1.6~rc2-0ubuntu1~xenial2 all office productivity suite -- Tango symbol style
(…)
coeurnoir@Asgard:~$
Pour Firefox et Thunderbird, je suis un peu étonné, ils devraient prendre le thème système par défaut il me semble… manque peut-être un ou des moteurs de rendu gtk sur ton système ?
Quelle version d'ubuntu, au fait ?