La doc pour KDE est hélas incomplète, et la réponse se trouve donc pour une raison quelconque sur la page de GNOME Logiciels
https://doc.ubuntu-fr.org/gnome-software#differences_avec_un_gestionnaire_de_paquets
En gros, tous les paquets ne sont pas des logiciels. Donc le gestionnaire de paquets va te permettre d'accéder à plus de choses que la logithèque, la contrepartie étant une interface moins accueillante que la logithèque Discover, et parfois "polluée" par des paquets qui ne te concernent pas du tout
