Ok, je te laisse essayer de convertir avec calibre.
Pour l'autre problème, les noyaux qui sont installés sur ta machine sont pas récents, je pense que l'erreur
E: Le paquet linux-headers-4.4.0-101 doit être réinstallé, mais il est impossible de trouver son archive.
t'empêche de faire tes mises à jour.
Je propose que tu démarres sur un noyau autre que le 4.4.0-101-generic (car on ne peut pas réparer un noyau lorsqu'on l'utilise) puis que tu donnes le retour
sudo apt-get update
sudo apt-get dist-upgrade
(c'est pour faire les mises à jour)
Pour démarrer sur un autre noyau, tu fais shift au démarrage du pc pour accéder au menu grub (si tu as un dual boot il devrait apparaître par défaut), puis tu fais options avancées, puis tu sélectionnes une ligne ne contenant ni upstart ni recovery, et tu prends pas le noyau 4.4.0-101.