+1 : et attention, le fait d'avoir utilise sudo tout nu peut d'ores et déjà avoir mis le bazar dans les droits et permissions des fichiers.
En dehors de pkexec, il y a
sudo -H mousepad
ou mieux encore, utiliser
admin://
exemple :
mousepad admin:///etc/apt/sources.list
Par ailleurs les messages d'erreur sont bénins : en fait on s'en fiche 😉