jmtrivia a écritPar contre, j'étais en POP sur l'ancienne installation, je suis passé en IMAP pour la nouvelle. Ceci pourrait il avoir une influence ?
Probablement, puisque le mode IMAP va chercher les messages directement sur le serveur distant, alors que le mode POP les enregistre dans le disque dur local. Toutefois, cela vaut surtout pour les anciens messages, les nouveaux devraient être lus normalement.
Je me demande si le fait d'avoir copié ton répertoire "~/.thunderbird" AVANT d'ouvrir la première fois la messagerie n'est pas à l'origine du problème, en supposant que cette première ouverture ait écrasé le contenu que tu avais copié dans le répertoire.
Tu devrais déjà juste essayer de refaire la copie et de relancer Thunderbid pour voir s'il y a du changement.