Alors je ne vais pas te faire un support Windows ici, mais dans mes souvenirs, il y a moyen d'exécuter un script ou un programme de manière régulière, inhérente au système. Sinon j'utilisais
Cobian backup, un petit soft bien pratique pour de la sauvegarde incrémentielle. Je pense qu'il faut que tu choisisse l'un des serveurs comme "référence", et que tous les autres pointent dessus. Après, Git, oui est idéal pour gérer les différentes versions...