bidou a écritmais lorsque je demande de remplacer } par } la commande sed me retourne \}??
À mon avis, tu t'es trompé dans ta ligne de commande, en mettant deux fois l'accolade fermante :
sed -e "s/}/\\\}/g" -e "s/}/\\\}/g" Sortie.md > QCM.moodle
Mais de toutes façons, ce que propose marcus68 est mieux : il vaut mieux éviter les guillemets doubles quand ils ne sont pas nécessaires, ça évite des protections de caractères supplémentaires.