la réponse est dans la doc :
https://doc.ubuntu-fr.org/apt-cli
apt : user friendly, c'est joli (pour l'utilisateur)
apt-get : le retour ne changera pas, utile pour parser le retour (pour les scripts)
donc non apt ne remplace pas vraiment apt-get, mais vu qu'avant il n'existait pas on utilisait toujours apt-get.
par contre maintenant il vaut généralement mieux documenter et utiliser apt.
apt-get ne s'en ira pas, et on peut l'utiliser dans ses scripts (bash par ex.).