Je suis également sous 12.04, et j'ai effectué une installation toute fraîche de giac, via le dépôt
deb http://www-fourier.ujf-grenoble.fr/~parisse/debian/ testing main
Je n'ai pas ce dysfonctionnement.
Par contre, une tentative d'installation faite il y a quelque temps s'était soldée par un échec.
Peut-être une réinstallation résoudra le problème.