La compatibilité de Wine est très aléatoire en fonction des logiciels. Concernant Kindle, les retours sur
AppDB (base de données de tests utilisateurs) sont très variables, certaines versions de l'appli fonctionnent parfaitement, d'autres pas du tout.
Il n'y a pas de retours sur les versions les plus récentes, donc c'est difficile de dire à coup sûr si la version actuelle fonctionne mais les résultats sur les dernières recensées (1.24 et 1.25) ne sont pas très encourageants. Auquel cas il faudrait essayer de trouver une version plus ancienne dont on sait qu'elle fonctionne (en théorie).
Quoi qu'il en soit, on peut essayer d'avoir plus d'infos en le lançant en ligne de commande. Si tu l'as installé dans le préfixe par défaut :
cd ~/.wine/drive_c/Program\ Files\ \(x86\)/Amazon/Kindle
wine Kindle.exe
Précise aussi ta version de Wine :
wine --version