Si tu veux tout chiffrer (y compris la ou les partitions système), non, il n'y a pas moyen.
Si tu veux seulement chiffrer une partition de données, oui.
Il faudra cependant copier ces données quelque part avant de fabriquer la partition chiffrée (ce qui va tout effacer dessus), puis rapatrier les données.
Voici un tutoriel :
https://doc.ubuntu-fr.org/tutoriel/chiffrer_ses_donnees
