J'ai réussi à résoudre une partie du problème avec la commande suivante :
xinput set-prop 'SONiX USB Keyboard Mouse' 'Coordinate Transformation Matrix' -1 0 1 0 -1 1 0 0 1
Ainsi, la souris se déplace correctement, mais le curseur est toujours la tête en bas, et lorsque je clique, ça clique toujours à l'opposé sur l'écran (si je clique en bas à droite, ça ouvre le menu déroulant de Ubuntu Mate en haut à gauche par exemple). Il faut donc que j'arrive à faire correspondre la zone pointée et le visuel de la souris
Damien.