J'ai bien une solution mais c'est de la bidouille et je ne sais pas si elle fonctionnera dans toutes les situations.
ART n'a pas l'air de vouloir la commande flatpak, il veut apparemment un exécutable. On peut créer un petit script qui va lancer la commande de GIMP et indiquer celui-ci à ART. On va l'appeler, disons, "flatgimp" et le mettre dans ~/.local/bin, qui est un dossier fait pour mettre des exécutables/scripts en local et qui est normalement dans le PATH.
D'abord, on crée le dossier au cas où il n'existe pas :
mkdir -p ~/.local/bin
Ensuite, on crée le script (si tu n'es pas sur GNOME, remplace gedit par ton éditeur de texte habituel) :
gedit ~/.local/bin/flatgimp
Dedans, mets ce qui suit et enregistre :
#!/bin/bash
flatpak run org.gimp.GIMP "$@"
Rends le script exécutable :
chmod +x ~/.local/bin/flatgimp
Une fois que c'est fait, vérifie qu'il fonctionne en tapant simplement
flatgimp dans un terminal : est-ce que GIMP se lance ? Si ce n'est pas le cas, c'est peut-être que le dossier ~/.local/bin n'existait pas et il faudrait relancer la session. Si après avoir relancé la session ça ne fonctionne toujours pas, on jettera un coup d'œil à ton .profile pour vérifier que la gestion de ce dossier est bien paramétrée.
En tout cas, si ça fonctionne, dans les paramètres d'ART, comme commande personnalisée, mets simplement
flatgimp et vérifie s'il ouvre bien ton image.