Ctrl-Alt-T, ça ouvre une fenêtre de terminal, dans une session graphique existante.
Ctrl-Alt-F2 etc, ça permet de démarrer une nouvelle session non-graphique. Donc c'est complètement différent, et je suis assez confiant sur le fait que ça te permette d'accéder à la ligne de commande 😉
Je ne connaissais pas byobu, mais c'est en effet une application graphique de terminal :
https://doc.ubuntu-fr.org/byobu
Tu n'aurais pas récemment installé un paquet qui aurait installé un environnement graphique en dépendance ? Car je trouve étrange que tu aies hérité d'un environnement graphique sorti de nulle part :/