Pour les paquets importants, ça a l'air bon. Qgis fonctionne toujours normalement ?
Pour le reste, tu peux commencer par supprimer ces vieux noyaux :
sudo apt-get remove --purge linux-headers-5.3.0-64 linux-headers-5.3.0-64-generic linux-image-5.3.0-18-generic linux-image-5.3.0-29-generic linux-image-5.3.0-40-generic linux-image-5.3.0-42-generic linux-image-5.3.0-45-generic linux-image-5.3.0-46-generic linux-image-5.3.0-51-generic linux-image-5.3.0-53-generic linux-image-5.3.0-55-generic linux-image-5.3.0-59-generic linux-image-5.3.0-61-generic linux-image-5.3.0-62-generic linux-image-5.3.0-64-generic linux-modules-5.3.0-18-generic linux-modules-5.3.0-29-generic linux-modules-5.3.0-40-generic linux-modules-5.3.0-42-generic linux-modules-5.3.0-45-generic linux-modules-5.3.0-46-generic linux-modules-5.3.0-51-generic linux-modules-5.3.0-53-generic linux-modules-5.3.0-55-generic linux-modules-5.3.0-59-generic linux-modules-5.3.0-61-generic linux-modules-5.3.0-62-generic linux-modules-5.3.0-64-generic linux-modules-extra-5.3.0-18-generic linux-modules-extra-5.3.0-29-generic linux-modules-extra-5.3.0-40-generic linux-modules-extra-5.3.0-42-generic linux-modules-extra-5.3.0-45-generic linux-modules-extra-5.3.0-46-generic linux-modules-extra-5.3.0-51-generic linux-modules-extra-5.3.0-53-generic linux-modules-extra-5.3.0-55-generic linux-modules-extra-5.3.0-59-generic linux-modules-extra-5.3.0-61-generic linux-modules-extra-5.3.0-62-generic linux-modules-extra-5.3.0-64-generic
installer ces paquets Mesa 32 bits manquants (ce n'est peut-être pas utile mais comme tu as d'autres paquets Mesa en 32 bits, autant que l'ensemble soit cohérent) :
sudo apt-get install libegl-mesa0:i386 libglu1-mesa:i386 mesa-va-drivers:i386 mesa-vdpau-drivers:i386
et il y a deux paquets à peut-être supprimer mais je ne suis pas sûr du principe (ce sont des paquets transitionnels) donc donne-moi d'abord le retour d'une simulation :
sudo apt-get remove -s --purge libegl1-mesa libgl1-mesa-glx