Déjà, pour savoir la nature d'un fichier, tu peux utiliser la commande "file" dans le terminal, qui va te donner le type "mime" du fichier.
Ainsi, quel que soit le suffixe (ou pas de suffixe du tout) du fichier, tu auras une idée de ce qu'il con tient réellement :
user@Ubuntu-Mate-2004:~/tests$ ll sinusoide toto.exe machin.txt
-rwxrwxr-x 1 user user 4 janv. 4 19:31 machin.txt*
-rwxrwxr-x 1 user user 805 juil. 14 2019 sinusoide*
-rw-rw-r-- 1 user user 4 janv. 4 19:30 toto.exe
user@Ubuntu-Mate-2004:~/tests$ file sinusoide toto.exe machin.txt
sinusoide: Bourne-Again shell script, UTF-8 Unicode text executable
toto.exe: ASCII text
machin.txt: ASCII text
user@Ubuntu-Mate-2004:~/tests$
Tu peux voir que le fichier "machin.txt" est coché comme exécutable alors que "toto.exe" est un texte simple. Mais de toute manière, la commande "file" ne se laisse pas abuser par ces noms, et elle montre que les deux ne sont que du texte simple.
Pour ce qui est de paramétrer le gestionnaire de fichiers, ben... ça dépend de la variante que tu utilises, chaque environnement a ses propres règles et ses propres logiciels. Chez moi, c'est Ubuntu-Mate, et mon gestionnaire de fichier est "Caja" qui se paramètre directement dans le logiciel, d'autres sont paramétrés globalement dans le menu des paramètres systèmes...