À première vue, ça a l'air ok. Relance la commande réelle (la même sans l'option -s) :
sudo apt-get remove --purge checkbox-ng command-not-found-data gcc-5-base gir1.2-javascriptcoregtk-3.0 gir1.2-webkit-3.0 gnome-icon-theme-symbolic libautodie-perl libavcodec57 libavformat57 libavutil55 libbrlapi0.6 libexempi3 libffi6 libfreerdp-common1.1.0 libfreerdp-plugins-standard libfreerdp-utils1.1 libgnome-keyring-common libgnome-keyring0 libgutenprint2 libicu60 libilmbase12 libjasper1 libjavascriptcoregtk-3.0-0 libjte1 libmagickcore-6.q16-3-extra libmagickcore-6.q16-3 libmagickwand-6.q16-3 libnih-dbus1 libnih1 libntdb1 libopenexr22 libp11-kit-gnome-keyring libpng12-0 libraw16 librsync1 libsndio6.1 libssl1.0.0 libswresample2 libswscale4 libvpx5 libwebkitgtk-3.0-0 libwebp5 libwinpr-crt0.1 libwinpr-environment0.1 libwinpr-file0.1 libwinpr-handle0.1 libwinpr-heap0.1 libwinpr-interlocked0.1 libwinpr-library0.1 libwinpr-path0.1 libwinpr-synch0.1 libwinpr-sysinfo0.1 libwinpr-thread0.1 libwinpr-utils0.1 libx264-152 libx265-146 module-init-tools multiarch-support obex-data-server perl-modules-5.26 plainbox-provider-checkbox plainbox-provider-resource-generic plainbox-secure-policy python-aptdaemon.gtk3widgets python-aptdaemon python-cups python-defer python-dirspec python-gconf python-gtk2 python-jwt python-notify python-ntdb python-oauthlib python-piston-mini-client python-renderpm python-reportlab-accel python-reportlab python-requests python-scour python-serial python-smbc python-talloc python-twisted-bin python-urllib3 python3-checkbox-ng python3-checkbox-support python3-guacamole python3-plainbox qtcore4-l10n qtdeclarative5-localstorage-plugin qtdeclarative5-test-plugin software-center-aptdaemon-plugins telepathy-haze telepathy-salut transfig unity-scope-chromiumbookmarks unity-scope-colourlovers unity-scope-firefoxbookmarks unity-scope-openclipart unity-scope-yelp ureadahead vdpau-va-driver
Ensuite, supprime les dépendances inutiles :
sudo apt-get autoremove --purge
Et enfin, on va vérifier que le méta-paquet du bureau est toujours là :
dpkg -l | grep ubuntu-desktop
Tu es bien sur la variante standard d'Ubuntu, avec l'environnement GNOME 3 ?