Cette piste était la bonne!
J'ai commencé par installé xdotool avec le .deb que propose benoit2600 dans son tutoriel:
http://crunchbang.net/packages-7.10.xx/pool/main/xdotool_20071230-crunchbang1_i386.deb
Pour attribuer le raccourcis ctrl+alt+d au bouton b:10 de ma souris par exemple il suffit de rajouter ces lignes à xbindkeysrc:
"xdotool key ctrl+alt+d"
b:10
Et là miracle tout fonctionne! Merci benoit2600.