Merci pour ta réponse. Mais en faisant un effort surhumain de mémoire, j'ai fini par m'en souvenir. Pour faire entrer et sortir Thunderbird du tray, la commande est :
alltray thunderbird &&
Il est à noté par contre, que les glisser - déposer ne fonctionnent plus dans TB quand il est ouvert par AllTray. C'est déjà mentionné dans la doc d'AllTray :
http://doc.ubuntu-fr.org/alltray. Ce bug existe depuis que je fais cette manip' et n'est manifestement pas résolu dans Karmic.