Normalement un truc du genre
sudo dd if=/dev/mmcblk0 of=~/chemin/vers/le/fichier/de/backup
où /dev/mmcblk0 est le nom de ta carte SD (à adapter après un sudo fdisk -l)
Il faut dans ton cas sauvegarder l'ensemble de ta carte et non pas seulement les partitions - car il te manquerait le mbr et la table des partitions.
Nota : il faut peut être préciser la taille des bloc copiés par un truc du genre bs=512