Il y a aussi une autre option à envisager : si tu utilises un autre client de messagerie, tu peux éventuellement utiliser cet applet pour ton client au lieu d'evolution.
Sinon, pour la suppression de cet applet, il faut simplement désinstaller le paquet indicator-messages via synaptic ou en tapant dans un terminal :
sudo apt-get remove indicator-messages
Une fois l'applet désinstallé il te suffit de te déconnecter puis te reconnecter à ta session pour ne plus avoir l'enveloppe dans les notifications.