Salut
C'est en effet pas très facile à l'occasion de la première ouverture d'un "lien externe" de savoir quoi faire exactement. C'est l'objet d'ailleurs d'une demande de fonctionnalité pour Kiwix :
https://sourceforge.net/tracker/?func=detail&aid=3327430&group_id=175508&atid=873518
Ce qu'il faut faire, c'est indiqué le chemin pour l'executable de Firefox qui se trouve dans /usr/bin/firefox. Ensuite Kiwix s'en rappelle et ouvrir automatiquement les liens web avec Firefox.
Pour toute demande ou rapport de bug:
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http://requestafeature.kiwix.org
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http://reportabug.kiwix.org
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http://www.kiwix.org/chat
Merci pour votre question
Kelson