Oui, tant qu'elle ne modifie pas le noyau linux. Ça à même été fait un paquet de fois. D'ailleurs il n'est pas interdit de faire tourner un logiciel propriétaire sur n'importe quelle distribution linux, donc à partir de là...
À lire avec attention:
http://fr.wikipedia.org/wiki/Licence_publique_g%C3%A9n%C3%A9rale_GNU