Salut mbooma,
j'ai également un portable avec 2 carte graphique : une intel et une ATI, donc comme toi.
La version précédente d'ubuntu que j'utilisait (10.10) le gérait très bien au travers de l'installation du pilote "propriétaire" d'ATI. J'avais la possibilité au travers du panneau de contrôle d'ATI de choisir quelle carte était activée, etc...
La version encore un peu instable actuelle d'unbuntu (11.10 soit oneiric) est encore un peu en cacahuète et il ne m'est pas encore possible d'installer le fameux pilote propriétaire permettant la prise en compte des deux cartes garphiques et leur gestion. D'ici là effectivement cela consomme beaucoup de batterie (les deux cartes graphiques sont en fonctionnement en permanence, aucune n'est désactivée pendant que l'autre est active) et cela ne fonctionne pas très bien.
Je pense que d'ici +/-1mois cela devra être règlé.
d'ici là si tu veux tu peux essayer l'installation du fameux pilote proprio d'ATI, cela semble fonctionner chez de nombreuse personnes déjà :
http://doc.ubuntu-fr.org/catalyst
http://mrrichard.hubpages.com/hub/2-Ways-to-Install-FGLRX-in-Ubuntu-1110-Oneric (c'est l'option 2)
attention, il est possible que tu dérègle ton ordi (enfin que ubuntu quand même), tu dois donc être ceinture noire de lignes de code incompréhensibles pour le remettre en état après ... si ce n'est pas le cas je te conseil de patienter un mois +/-