Salut
D'après ce que j'ai googlé, le processus d'authentification est externe à Squid, donc c'est du côté du processus d'authentification qu'il faut regarder ça.
Certains utilisent la commande chpasswd, appliquée à un fichier de paires user:passsword :
http://www.delafond.org/traducmanfr/man/man8/chpasswd.8.html