même root ne peut pas décrypter les home chiffrés s'il ne connait pas les passes (heureusement)
donc j'en conclus que tu connais leurs pass-phrases
dans ce cas il faudra l'indiquer dans le fichier /etc/crypttab pour le déchiffrage automatique au démarrage
mais il faut avant tout savoir si les home ont chacun leur partition ou sont de type lvm (volume logique) (je ne connais pas ce que fait la procédure par défaut)
tu les montent avec nautilus qui te demandera le pass et ensuite:
ls /dev/mapper
cat /etc/crypttab
sudo lvdisplay
mount
donneront les informations nécessaires
sinon, pour ne pas indiquer les passphrases aux démarrage, il existe une méthode qui consiste a renseigner les pass dans un fichier, par exemple sur une cle usb
edit: si le chiffrement est de type luks AES (voir gparted pour vérifier) tu trouveras toutes les réponses sur cette page:
http://doc.ubuntu-fr.org/cryptsetup
