Salut !
En fait, ce n'est pas compliqué : il suffit d'activer NFS (le truc pour échanger des fichiers sous réseaux Unix) dans ton NAS, sur ton ordinateur, suivre la documentation d'ubuntu/de synology pour monter (comprendre : avoir accès à) via NFS ton disque branché sur ton synology, et enfin, installer un logiciel de synchronisation (que tu as cité), pour faire une sauvegarde tout les temps X, du truc A, sur le disque monté via NFS.
Un exemple de tutoriel pour utiliser NFS avec un synology :
http://blog.nicolargo.com/2010/11/utilisation-du-protocole-nfs-avec-votre-nas.html
Pour rsync : voir la documentation d'ubuntu-fr.
Tu sais, on ne peut cogiter à ta place : tu n'a qu'à appliquer bêtement les docs, ou chercher un post de blog.
Comme solution alternative à ton problème, ça :
http://blog.dahanne.net/2011/07/11/nas-synology-pour-les-sauvegardes-et-pour-diffuser-les-medias/
3sec de recherche google ("NAS synology ubuntu sauvegarde") m'ont menées dessus.
Après, tu peux aussi aller sur les forums d'utilisateurs de synology : tu auras plus de réponses qu'ici, étant plus spécialisé.