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[HowTo] Installation et lancement automatique de FAH pour Ubuntu !

Spirzouf

bah non, c'est justement à cause du bordel que c'est avec ces scripts pour pouvoir régler le pourcentage d'utilisation du proc... là, au moins c'est simple 😛

C'est peut être boulet, mais au moins j'arrive à le faire fonctionner à 20% si je veux... Parce que vos script, ça me parait bien compliqué et surtout bien expérimental (sans aucune désobligeance) 😃

sylvain1970

Bonjour,
ce n'est pas expérimental, çà fonctionne très bien (je ne prends pas mal ta phrase, j'explique seulement 😉).
par contre, cela utilise le proc à 100% MAIS seulement les ressources non utilisées.
cad que dès que le proc a besoin de ressource pour faire autre chose, l'utilisation du proc par FAH est réduite d'autant.
comme çà, ton proc est toujours à 100% mais disponible si besoin.

Spirzouf

Bonjour !

Oui, le FAH linux marche très bien, je l'avais installé initialement.
Le seul truc, c'est que faire tourner mon proc à 100% en permanence (même si j'ai bien compris que c'était exécuté en priorité basse, laissant le proc libre pour les autres appli) m'embête un peu en raison de la température processeur (en particulier pour l'été à venir).
Donc je parlais des scripts destinés à réduire l'utilisation proc, qui doivent certainement bien marcher mais me semblent un peu délicats à mettre en Å“uvre (me concernant bien sûr).

sylvain1970

Ah, oui, là, ok 🙂

[supprimé]

Heu une idée pour faire fonctionné f@h avec 2 instances???

Ras'

2 dossiers différents, et 2 machines ID différents (tu change ça en lançant le client avec -configonly)
Si c'est pour un dualcore je crois qu'il y a quelque chose qui s'apelle smp mais j'en connais pas plus, demande sur le forum de l'alliance francophone :
http://folding.mesdiscussions.net/foldinghome/liste_categorie.htm

sylvain1970

Pour info, le smp ne fonctionne que sous linux 64 bits.
Mais il faut laisser l'ordi allumé quasiment 24H/24H pour tenir les deadlines.

_Enchained

Aux contributeurs de la page http://doc.ubuntu-fr.org/fah :
Je vous suggère de déplacer la page à un nom plus parlant comme : http://doc.ubuntu-fr.org/folding_at_home 😉

Ras'

En cherchant "folding at home" dans la doc on trouve donc en partant de là... En général les gens qui connaissent 'folding @ home' connaissent l'abréviation f@h, enfin c'est ce que j'en dit ^^

Ras'

Pour hardy je me suis installé une 64 bits, comme ça je peux utiliser fah en smp (utilisation des deux cores, WU "plus importantes" et raportant plus de points). Pour l'occasion je me suis fait un petit script que j'ai intégré au bureau grâce à un gnome-terminal et à compiz :

Le script se lance au démarrage, demande "on plie aujourd'hui ?" par une fenêtre zenity, si je répond oui fah6 se lance. Les températures et l'avancement sont mis à jours toutes les 2mn, les stats toutes les 2 heures.
Si la température des cores passe au dessus de 80° le script est arreté.

J'ai pas fait un script aussi complet que celui de la doc dans le sens ou y'a pas de fonction stop etcetc, j'ai juste adapté un truc à mes besoins, je le retravaillerais peut être plus tard.
Si y'en à que ça interesse je pourais le poster 😉

sylvain1970

Bonjour,
le script m'intéresse.
l'affichage, c'est conky ?, m'intéresse aussi celui-là. 🙂

Ras'

je mettrais le script plus tard faut que je modifie un ou deux trucs dedans ^^
L'affichage c'est un gnome terminal intégré au bureau grâce à compiz, on doit pouvoir faire afficher la même chose avec conky, suffit de chercher 😉

Ras'

Désolé j'suis parti en vacances et du coup j'ai oublié de le poster ^^

Donc voila le script, un peu à l'arrache mais il fait ce que je veux c'est le principal.
je l'ai modifié donc maintenant il n'affiche plus que deux lignes dans "Avancement", et j'ai aussi rajouté le le nombre de personne total dans le classement :
team rank :
2438 / 14842

Le team rank est exact vu qu'il se base sur la page de stats de la team, le global rank doit être faux puisqu'il se base sur le global rank du dernier de la team française, qui n'est pas forcément dernier mondial, mais à mon avis on doit pas être loin, et c'est juste à titre indicatif 😉

Le voila :

#!/bin/bash
#
# But : Lancer fah en smp et afficher des informations complémentaire à fahmon
# Créateur : Ras'
#

pseudo="Ras'"

color()
{
printf '\033[%sm%s\033[m\n' "$@" 
}

sleep 2
zenity --question --title="Folding @ Home" --text="Hey $pseudo !
On plie aujourd'hui ?"
if ! [[ $? == "0" ]]
then exit
fi

cd $HOME/Folding/Fah
(./fah6 -smp >/dev/null)&


wget -q -O .stats http://fah-web.stanford.edu/teamstats/team51.html
t=0

while true
do
	until [[ $t -ne "60" ]]
	do
	wget -q -O .stats http://fah-web.stanford.edu/teamstats/team51.html
	t=0
	done

temp=$( sensors | cut -f1 -d "(" | grep -o '+[0-9]*.[0-9]' | grep -o "[0-9]*" | head -1 )
	if [[ $temp -gt 80 ]]
	then
	killall -9 fah6
	echo "Température des cores trop élevé ( > 80°C )
Folding @ Home à été arreté
Veuillez attendre que les processeurs refroidissent avant de relancer f@h"
	fi

clear
echo `color 1 "$pseudo"`
echo `color 0 "Team 51"`
echo `color 34 "$( date +%HH\ %MM\ %SS )"`

echo ""

echo `color 1 "Projet :"`
color 34 "`cat /home/ras/Folding/Fah/FAHlog.txt | grep Project | tail -1 | cut -f2 -d "]"`"
echo ""
echo `color 1 "Avancement :"`
color 34 "`tail /home/ras/Folding/Fah/FAHlog.txt | grep Completed  | tail -2`"

echo ""
echo `color 1 "Cores Temperature :"`
color 34 "`sensors | grep "Core"`"
echo ""

# Stats de l'user
set -- `cat .stats | grep "Ras'" | grep -o "[0-9]*"`
globrank_user="$1"
teamrank_user="$2"
credits_user="$3"
wufolded_user="$4"

# Stats du dernier de la team
set -- `tail -3 .stats | grep -o [0-9]*`
globrank_total="$1"
teamrank_total="$2"


echo `color 1 "Global rank :"`
echo `color 34 "$globrank_user / $globrank_total"`

echo `color 1 "Team rank :"`
echo `color 34 "$teamrank_user / $teamrank_total"`

echo `color 1 "Credits :"`
echo `color 34 "$credits_user"`

echo `color 1 "WU folded :"`
echo `color 34 "$wufolded_user"`

sleep 2m
t=$(( t + 1))
done

L'affichage c'est ça : http://forum.ubuntu-fr.org/viewtopic.php?id=207163

Ras'

Petite question pour les utilisateurs de smp :
est ce que la copie de fichier marche bien chez vous ?

J'ai l'impression que nautilus ne prend pas les ressources dont il à besoin, la je suis en train de copier sur mon dde et ça va à 3.4Mio/s pas très vif pour de l'usb 2 :\
peut être que le problème vien d'ailleurs mais c'est le seul truc logique que j'ai trouvé ...

www.rzr.online.fr

boinc fait pas la meme chose ?

Ras'

Boinc ne compte pas F@h dans sa liste.
http://fr.wikipedia.org/wiki/Liste_des_projets_BOINC

F@h c'est pour le calcul du repliement des protéines.

www.rzr.online.fr

Ras' a écritBoinc ne compte pas F@h dans sa liste.
http://fr.wikipedia.org/wiki/Liste_des_projets_BOINC

F@h c'est pour le calcul du repliement des protéines.

dommage

une piste : http://folding.stanford.edu/English/FAQ-highperformance#ntoc10

par contre y a protein@home sous boinc

sinon ya une equipe linux users ww sur rosetta :
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/team_members.php?teamid=9&sort_by=total_credit&offset=0

--
http://rzr.online.fr/q/compute

Ras'

Mouai, enfin on m'avais parlé d'inconvénients avec boinc (genre pour les délais de renvoi au serveur je crois, je me rapelle plus trop...), et puis comme je fais que du folding il n'y a aucun interêt à l'utiliser.

sylvain1970

Merci pour le script Ras'.
Je vais voir si je peux l'adapter à mes besoins.

YannUbuntu

Bonjour, je fais un UP au sujet du nouvel installateur de F@H :
http://forum.ubuntu-fr.org/viewtopic.php?id=235967

Quelqu'un a-t-il essayé? 🙂

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